НИИ генетической и молекулярной эпидемиологии

ЛАБОРАТОРИЯ СТАТИСТИЧЕСКОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОИНФОРМАТИКИ

СОТРУДНИКИ

Полоников Алексей Валерьевич  - заведующий лабораторией, д.м.н., профессор;

Стецкая Татьяна Анатольевна  - младший научный сотрудник, к.м.н.;

Москалев Александр Сергеевич  - младший научный сотрудник.

НАПРАВЛЕНИЯ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ ЛАБОРАТОРИИ:

  • Использование современных методов генетической статистики и биоинформатики для изучения вариабельности генома человека и его вклада в полигенные механизмы развития социально значимых мультифакториальных заболеваний.
  • Генетико-эпидемиологические исследования молекулярно-генетических и биохимических механизмов реализации наследственной предрасположенности к мультифакториальным заболеваниям человека с использованием современных методов статистической генетики и биоинформатики.
  • Моделирование межгенных и генно-средовых взаимодействий, детерминирующих предрасположенность к мультифакториальным заболеваниям.
  • Разработка алгоритмов использования биоинформатических методов и ресурсов для моделирования патологических процессов, лежащих в основе социально значимых заболеваний, и выявления новых молекулярных и клеточных мишеней для их терапии

ОБЛАСТЬ НАУЧНЫХ ИНТЕРЕСОВ

Генетическая и молекулярная эпидемиология, экологическая генетика, генетика мультифакториальных (многофакторных) заболеваний, статистическая генетика, биоинформатика, функциональное аннотирование SNP, моделирование взаимодействия генов, персонализированная медицина, фармакогенетика, молекулярная диагностика.

              

ИЗБРАННЫЕ ПУБЛИКАЦИИ СОТРУДНИКОВ ЛАБОРАТОРИИ

1: Ponomarenko I, Reshetnikov E, Polonikov A, Verzilina I, Sorokina I, Yermachenko A, Dvornyk V, Churnosov M. Candidate Genes for Age at Menarche Are Associated With Uterine Leiomyoma. Front Genet. 2021 Jan 22;11:512940. doi:10.3389/fgene.2020.512940.

2: Ponomarenko I, Reshetnikov E, Polonikov A, Verzilina I, Sorokina I, Elgaeva EE, Tsepilov YA, Yermachenko A, Dvornyk V, Churnosov M. Candidate genes for age at menarche are associated with endometriosis. Reprod Biomed Online. 2020 Nov;41(5):943-956. doi: 10.1016/j.rbmo.2020.04.016.

3: Azarova I, Klyosova E, Lazarenko V, Konoplya A, Polonikov A. Genetic variants in glutamate cysteine ligase confer protection against type 2 diabetes. Mol Biol Rep. 2020 Aug;47(8):5793-5805. doi: 10.1007/s11033-020-05647-5.

4: Polonikov A, Rymarova L, Klyosova E, Volkova A, Azarova I, Bushueva O, Bykanova M, Bocharova I, Zhabin S, Churnosov M, Laskov V, Solodilova M. Matrix metalloproteinases as target genes for gene regulatory networks driving molecular and cellular pathways related to a multistep pathogenesis of cerebrovascular disease. J Cell Biochem. 2019 Oct;120(10):16467-16482. doi: 10.1002/jcb.28815.

5: Polonikov AV, Ponomarenko IV, Bykanova MA, Sirotina SS, Bocharova AV, Vagaytseva KV, Stepanov VA, Azarova IE, Churnosov MI, Solodilova MA. A comprehensive study revealed SNP-SNP interactions and a sex-dependent relationship between polymorphisms of the CYP2J2 gene and hypertension risk. Hypertens Res. 2019 Feb;42(2):257-272. doi: 10.1038/s41440-018-0142-1.

6: Sirotina S, Ponomarenko I, Kharchenko A, Bykanova M, Bocharova A, Vagaytseva K, Stepanov V, Churnosov M, Solodilova M, Polonikov A. A Novel Polymorphism in the Promoter of the CYP4A11Gene Is Associated with Susceptibility to Coronary Artery Disease. Dis Markers. 2018 Feb 1;2018:5812802. doi: 10.1155/2018/5812802.

7: Mühleisen TW, Reinbold CS, Forstner AJ, Abramova LI, Alda M, Babadjanova G, Bauer M, Brennan P, Chuchalin A, Cruceanu C, Czerski PM, Degenhardt F, Fischer SB, Fullerton JM, Gordon SD, Grigoroiu-Serbanescu M, Grof P, Hauser J, Hautzinger M, Herms S, Hoffmann P, Kammerer-Ciernioch J, Khusnutdinova E, Kogevinas M, Krasnov V, Lacour A, Laprise C, Leber M, Lissowska J, Lucae S, Maaser A, Maier W, Martin NG, Mattheisen M, Mayoral F, McKay JD, Medland SE, Mitchell PB, Moebus S, Montgomery GW, Müller-Myhsok B, Oruc L, Pantelejeva G, Pfennig A, Pojskic L, Polonikov A, Reif A, Rivas F, Rouleau GA, Schenk LM, Schofield PR, Schwarz M, Streit F, Strohmaier J, Szeszenia-Dabrowska N, Tiganov AS, Treutlein J, Turecki G, Vedder H, Witt SH, Schulze TG, Rietschel M, Nöthen MM, Cichon S. Gene set enrichment analysis and expression pattern exploration implicate an involvement of neurodevelopmental processes in bipolar disorder. J Affect Disord. 2018 Mar 1;228:20-25. doi: 10.1016/j.jad.2017.11.068.

8: Polonikov A, Kharchenko A, Bykanova M, Sirotina S, Ponomarenko I, Bocharova A, Vagaytseva K, Stepanov V, Bushueva O, Churnosov M, Solodilova M. Polymorphisms of CYP2C8, CYP2C9 and CYP2C19 and risk of coronary heart disease in Russian population. Gene. 2017 Sep 5;627:451-459. doi: 10.1016/j.gene.2017.07.004.

9: Vonk JM, Scholtens S, Postma DS, Moffatt MF, Jarvis D, Ramasamy A, Wjst M, Omenaas ER, Bouzigon E, Demenais F, Nadif R, Siroux V, Polonikov AV, Solodilova M, Ivanov VP, Curjuric I, Imboden M, Kumar A, Probst-Hensch N, Ogorodova LM, Puzyrev VP, Bragina EY, Freidin MB, Nolte IM, Farrall AM, Cookson WO, Strachan DP, Koppelman GH, Boezen HM. Adult onset asthma and interaction between genes and active tobacco smoking: The GABRIEL consortium. PLoS One. 2017 Mar 2;12(3):e0172716. doi: 10.1371/journal.pone.0172716.

10: Forstner AJ, Hecker J, Hofmann A, Maaser A, Reinbold CS, Mühleisen TW, Leber M, Strohmaier J, Degenhardt F, Treutlein J, Mattheisen M, Schumacher J, Streit F, Meier S, Herms S, Hoffmann P, Lacour A, Witt SH, Reif A, Müller-Myhsok B, Lucae S, Maier W, Schwarz M, Vedder H, Kammerer-Ciernioch J, Pfennig A, Bauer M, Hautzinger M, Moebus S, Schenk LM, Fischer SB, Sivalingam S, Czerski PM, Hauser J, Lissowska J, Szeszenia-Dabrowska N, Brennan P, McKay JD, Wright A, Mitchell PB, Fullerton JM, Schofield PR, Montgomery GW, Medland SE, Gordon SD, Martin NG, Krasnov V, Chuchalin A, Babadjanova G, Pantelejeva G, Abramova LI, Tiganov AS, Polonikov A, Khusnutdinova E, Alda M, Cruceanu C, Rouleau GA, Turecki G, Laprise C, Rivas F, Mayoral F, Kogevinas M, Grigoroiu-Serbanescu M, Becker T, Schulze TG, Rietschel M, Cichon S, Fier H, Nöthen MM. Identification of shared risk loci and pathways for bipolar disorder and schizophrenia. PLoS One. 2017 Feb 6;12(2):e0171595. doi: 10.1371/journal.pone.0171595.

11: Polonikov AV, Bushueva OY, Bulgakova IV, Freidin MB, Churnosov MI, Solodilova MA, Shvetsov YD, Ivanov VP. A comprehensive contribution of genes for aryl hydrocarbon receptor signaling pathway to hypertension susceptibility. Pharmacogenet Genomics. 2017 Feb;27(2):57-69. doi: 10.1097/FPC.0000000000000261.

12: Bushueva OY, Stetskaya TA, Korogodina TV, Ivanov VP, Polonikov AV. Issledovanie vzaimosvyazi polimorfizmov HindIII gena LPL i Taq1b gena CETP s riskom razvitiya aterotromboticheskogo insul'ta u zhitelei Tsentral'noi Rossii [Investigation of the association between the HindIII polymorphism of the LPL gene and the Taq1b polymorphism of the CETP gene with the risk of atherothrombotic stroke in the dwellers of Central Russia]. Ter Arkh. 2015;87(8):86-91. Russian. doi: 10.17116/terarkh201587886-91.

13: Forstner AJ, Hofmann A, Maaser A, Sumer S, Khudayberdiev S, Mühleisen TW, Leber M, Schulze TG, Strohmaier J, Degenhardt F, Treutlein J, Mattheisen M, Schumacher J, Breuer R, Meier S, Herms S, Hoffmann P, Lacour A, Witt SH, Reif A, Müller-Myhsok B, Lucae S, Maier W, Schwarz M, Vedder H, Kammerer-Ciernioch J, Pfennig A, Bauer M, Hautzinger M, Moebus S, Priebe L, Sivalingam S, Verhaert A, Schulz H, Czerski PM, Hauser J, Lissowska J, Szeszenia-Dabrowska N, Brennan P, McKay JD, Wright A, Mitchell PB, Fullerton JM, Schofield PR, Montgomery GW, Medland SE, Gordon SD, Martin NG, Krasnov V, Chuchalin A, Babadjanova G, Pantelejeva G, Abramova LI, Tiganov AS, Polonikov A, Khusnutdinova E, Alda M, Cruceanu C, Rouleau GA, Turecki G, Laprise C, Rivas F, Mayoral F, Kogevinas M, Grigoroiu-Serbanescu M, Propping P, Becker T, Rietschel M, Cichon S, Schratt G, Nöthen MM. Genome-wide analysis implicates microRNAs and their target genes in the development of bipolar disorder. Transl Psychiatry. 2015 Nov 10;5(11):e678. doi: 10.1038/tp.2015.159.

14: Polonikov AV, Ushachev DV, Ivanov VP, Churnosov MI, Freidin MB, Ataman AV, Harbuzova VY, Bykanova MA, Bushueva OY, Solodilova MA. Altered erythrocyte membrane protein composition mirrors pleiotropic effects of hypertension susceptibility genes and disease pathogenesis. J Hypertens. 2015

Nov;33(11):2265-77. doi: 10.1097/HJH.0000000000000699.

15: Polonikov AV, Ivanov VP, Bogomazov AD, Freidin MB, Illig T, Solodilova MA. Antioxidant defense enzyme genes and asthma susceptibility: gender-specific effects and heterogeneity in gene-gene interactions between pathogenetic variants of the disease. Biomed Res Int. 2014;2014:708903. doi: 10.1155/2014/708903

16: Mühleisen TW, Leber M, Schulze TG, Strohmaier J, Degenhardt F, Treutlein J, Mattheisen M, Forstner AJ, Schumacher J, Breuer R, Meier S, Herms S, Hoffmann P, Lacour A, Witt SH, Reif A, Müller-Myhsok B, Lucae S, Maier W, Schwarz M, Vedder H, Kammerer-Ciernioch J, Pfennig A, Bauer M, Hautzinger M, Moebus S, Priebe L, Czerski PM, Hauser J, Lissowska J, Szeszenia-Dabrowska N, Brennan P, McKay JD, Wright A, Mitchell PB, Fullerton JM, Schofield PR, Montgomery GW, Medland SE, Gordon SD, Martin NG, Krasnow V, Chuchalin A, Babadjanova G, Pantelejeva G, Abramova LI, Tiganov AS, Polonikov A, Khusnutdinova E, Alda M, Grof P, Rouleau GA, Turecki G, Laprise C, Rivas F, Mayoral F, Kogevinas M, Grigoroiu-Serbanescu M, Propping P, Becker T, Rietschel M, Nöthen MM, Cichon S. Genome-wide association study reveals two new risk loci for bipolar disorder. Nat Commun. 2014 Mar 11;5:3339. doi: 10.1038/ncomms4339. PMID: 24618891.

17: Stetskaia TA, Bushueva OIu, Bulgakova IV, Vialykh EK, Shuteeva TV, Biriukov AE, Ivanov VP, Polonikov AV. [Association of T174M polymorphism of the angiotensinogen gene with the higher risk of cerebral stroke in women]. Ter Arkh. 2014;86(12):66-71. Russian. doi: 10.17116/terarkh2014861266-71.

18: Yarosh SL, Kokhtenko EV, Starodubova NI, Churnosov MI, Polonikov AV. Smoking status modifies the relation between CYP1A1*2C gene polymorphism and idiopathic male infertility: the importance of gene-environment interaction analysis for genetic studies of the disease. Reprod Sci. 2013 Nov;20(11):1302-7. doi: 10.1177/1933719113483013.

19: Polonikov AV, Ivanov VP, Solodilova MA. Genetic variation of genes for xenobiotic-metabolizing enzymes and risk of bronchial asthma: the importance of gene-gene and gene-environment interactions for disease susceptibility. J Hum Genet. 2009 Aug;54(8):440-9. doi: 10.1038/jhg.2009.58.

20: СтецкаяТ.А.Проявление полового диморфизма в асоциации полиморфного варианта M235T гена AGT с риском развития артериальной гипертензии в популяции Центрально-Черноземного региона России [Текст] / Т.А.Стецкая [идр.]//Международныйнаучно-исследовательскийжурнал.–Екатеринбург, 2013. – № 8 (15). Ч. 4. – С. 37-39 (Материалы XVIII заочной научной конференции Research Journal of Internationa lStudies ,Екатеринбург,2013г.).

21: СтецкаяТ.А .Анализ взаимосвязи полиморфизма М235Т генаAGT сриском развития мозгового инсульта на фоне артериальной гипертензии [Текст] /Т.А. Стецкая, О.Ю. Бушуева // Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий имедицины. – Ростов-на-Дону, 2013. – С. 241 (Материалы V Международной научно-практическойконференции,Ростов-на-Дону,3-5октября2013г.).

22: СтецкаяТ.А.Исследование ассоциации полиморфизма A1166C гена AGTR1 с риском развития мозгового инсульта на фоне артериальной гипертензии[Текст] / Т.А. Стецкая [и др.] // Инновационное развитие современной науки. – Уфа,2014.–Т.33.Ч.6.–С.107-109(Сборникстатеймеждународнойнаучно-практическойконференции,Уфа, 31 января2014г.).

23: I/D-полиморфизм гена ACE ассоциирован с развитием ГБ у русских жителей Центрального Черноземья [Текст]/О.Ю.Бушуева,Т.А.Стецкая[идр.]//От стандартизированной к индивидуализированной терапии. Лечим не болезнь, абольного.–Курск,2014.–С.271-274(Материалымеждународнойнаучно-практическойконференции,Курск, 18 марта2014г.).

24: Стецкая Т.А. Анализ взаимосвязи полиморфизма –344С/Т гена CYP11B2с риском развития мозгового инсульта на фоне артериальной гипертензии [Текст] /Т.А. Стецкая [и др.] // Молодежная наука и современность. – Курск, 2014. – С. 94(Материалы79-йВсероссийскойнаучнойконференциистудентовимолодыхученых смеждународным участием,Курск,16-17апреля2014 г.).

25: Исследование ассоциации полиморфизма A1166C гена AGTR1 с рискомразвития мозгового инсульта в популяции русских жителей Центральной России[Текст]/О.Ю.Бушуева,Т.А.Стецкая[идр.]//Журналклiнiчнихтаекспериментальнихмедичних дослiджень.–2014.– Т.2,№2.– С.176-184.9.

26: Стецкая Т.А. Исследование взаимосвязи I/D полиморфизма гена ACE сриском развитиямозгового инсульта в популяции русских жителей Центрально-Черноземного региона России [Текст] / Т.А.Стецкая [и др.] // Курский научно-практическийвестник«Человек иегоздоровье».–2014.–№3.–С.33-37.

27: Stetskaya T. The Relationship Between the –344C> T Polymorphism of Gene Encoding Aldosterone Synthase and the Prothrombin Time in Patients With Intracerebral Hemorrhage [Tеxt] / T. Stetskaya [et al.] // Journal of Neurological Sciences – Turkish, 2015. – Vol. 32, – № 1. – P. 9-15.

28: СтецкаяТ.А.Полиморфизм+1675G>AгенаAGTR2ассоциировансразвитием ишемического инсульта [Текст] / Т.А. Стецкая [и др.] // Медицинскаягенетика.– 2017.–№ 3. –С.33-36.

29: Рымарова Л.В., Клёсова E.Ю., Волкова А.В., Бушуева О.Ю., Азарова Ю.Э., Ласков В.Б., Полоников А.В. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов матриксных металлопротеиназ 1 и 2 типов с риском развития ишемического инсульта: пилотное исследование у жителей Центральной России // Научные ведомости БелГУ. Сер. Медицина. Фармация. – 2018. – № 2, – Т. 41. – С. 280–287.

30:Рымарова Л.В., Клёсова E.Ю., Волкова А.В., Бушуева О.Ю., АзароваЮ.Э., ЛасковВ.Б., ПолониковА.В. Курение как провоцирующий фактор риска развития ишемического инсульта у лиц генетическим вариантом rs486055 матрикснойметаллопротеиназы - 10 //«Курскийнаучно-практическийвестник «Человекиего здоровье»».–Курск,2018.–№1.–С.115–120.

31. Москалев А.С., Барышева Е.М., Солдатов В.О., Фролова О.Г., Бобынцева О.В., Самгина Т.А., Чурносов М.И., Иванов В.П., Полоников А.В., Бушуева О.Ю. Ассоциация полиморфного варианта C3435T (rs1045642) гена MDR1 с повышенным риском развития колоректального рака у русских женщин Центральной России. Генетика. 2019. Т. 55. № 12. С. 1417-1423.

32. Москалев А.С., Солдатов В.О., Вдовина И.Н., Иванова Н.В., Иванов В.П., Полоников А.В., Бушуева О.Ю. Исследование взаимосвязи полиморфизмов I462V гена CYP1A1 и -154C>A гена CYP1A2 c риском развития колоректального рака у русских жителей Центральной России. Медицинская генетика. 2017. Т. 16. № 3. С. 41-45.